New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 = 78351035 (0.710)6 (0.120) 4/56 NT 12.8% coding (995/1434 nt) ybhI predicted transporter
?REL606 = 4141016 47 (0.760)coding (89/705 nt) yijC DNA‑binding transcriptional repressor

AAAGGCGGCTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTA  >  REL606/783476‑783545
                                  |                                   
aaaGGCGGCTGGCATACCTTAATCTGGTACGGCGGt                                    <  1:4877078/36‑1 (MQ=255)
aaaGGCGGCTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGg                                    >  1:1237391‑M1/1‑35 (MQ=255)
aaaGGCGGCTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGg                                    >  1:2604152‑M1/1‑35 (MQ=255)
  aGGCGGCTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGtat                                  <  1:7482024/36‑1 (MQ=255)
  aGGCGGCTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGggt                                  >  1:4074373‑M1/1‑33 (MQ=255)
  aGGCGGCTGGAATACCTTAAACTGGTACGGCGGtat                                  <  1:1241251/36‑1 (MQ=255)
   ggcggcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGtgtt                                 >  1:7172511/1‑36 (MQ=255)
    gcggcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGtatta                                <  1:375091/36‑1 (MQ=255)
     cggcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGtattat                               <  1:1506969/36‑1 (MQ=255)
     cggcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGggtttt                               >  1:7202282‑M1/1‑30 (MQ=255)
      ggcTGGAATACCTTAATCTGGTGCGGCGGTATTATc                              <  1:5148276/36‑1 (MQ=255)
      ggcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGttttgtt                              >  1:855446/1‑33 (MQ=37)
      ggcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGgtttttt                              >  1:437479‑M1/1‑29 (MQ=255)
       gcTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCg                             <  1:3951247/36‑1 (MQ=255)
        cTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCgg                            <  1:4547502/36‑1 (MQ=255)
         tGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGc                           <  1:4570991/36‑1 (MQ=255)
           gAATACCTTAATCTGGTACGGCGGgttttttttttt                         >  1:2278046‑M1/1‑24 (MQ=255)
           gAATACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCtt                         <  1:3800904/36‑1 (MQ=255)
            aaTACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTa                        <  1:7864532/36‑1 (MQ=255)
              tACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAg                      <  1:5304776/36‑1 (MQ=255)
                  ttAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTcc                  <  1:7403708/36‑1 (MQ=255)
                  ttAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTcc                  <  1:6077720/36‑1 (MQ=255)
                   tAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCt                 <  1:6541388/36‑1 (MQ=255)
                      tCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttat              <  1:763085/36‑1 (MQ=255)
                      tCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttat              <  1:1782660/36‑1 (MQ=255)
                      ccTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttat              <  1:683962/35‑1 (MQ=255)
                       cTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttatt             <  1:7323881/36‑1 (MQ=255)
                        tgttACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttatta            <  1:1040431/33‑1 (MQ=255)
                        tGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttatta            <  1:2397131/36‑1 (MQ=255)
                        tGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttatta            <  1:4781838/36‑1 (MQ=255)
                        tGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCttatta            <  1:5997329/36‑1 (MQ=255)
                         ggTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCTtattat           <  1:6734484/36‑1 (MQ=255)
                          gTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATc          <  1:5885452/36‑1 (MQ=255)
                          gTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATc          <  1:7177598/36‑1 (MQ=255)
                            aCGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGa        <  1:7951618/36‑1 (MQ=255)
                             cggcggTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGaa       <  1:3558271/36‑1 (MQ=255)
                             cggcggTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGaa       <  1:2498643/36‑1 (MQ=255)
                              ggcggTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCTaaa      >  1:7863807/1‑36 (MQ=255)
                              ggcggTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGaaa      <  1:6429902/36‑1 (MQ=255)
                              ggcggTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGaaa      <  1:7952934/36‑1 (MQ=255)
                                 ggTATTATCGGCTTAAGTTCCTTATTATCGAAAGtt   >  1:5026509/1‑36 (MQ=255)
                                  gTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTa  >  1:2883275/1‑36 (MQ=255)
                                  gTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTa  >  1:4790976/1‑36 (MQ=255)
                                  gTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTa  <  1:2153861/36‑1 (MQ=255)
                                  gTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTa  >  1:7752280/1‑36 (MQ=255)
                                  gTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTa  <  1:1122466/36‑1 (MQ=255)
                                  gTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTa  >  1:8421671/1‑36 (MQ=255)
                                  |                                   
AAAGGCGGCTGGAATACCTTAATCTGGTACGGCGGTATTATCGGCTTAAGCTCCTTATTATCGAAAGTTA  >  REL606/783476‑783545

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 11 ≤  ATCG  < 22 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG