Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
MC JC | REL606 | 3,894,997 | Δ6,934 bp | 100% | IS150‑mediated | rbsD–[yieO] | rbsD, rbsA, rbsC, rbsB, rbsK, rbsR, [yieO] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 3894997 | 3901930 | 6934 | 54 [3] | [0] 44 | rbsD–[yieO] | rbsD, rbsA, rbsC, rbsB, rbsK, rbsR, [yieO] |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | 37 (0.670) | 27/64 | NT | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 3901931 = | 0 (0.000) | coding (489/1428 nt) | yieO | predicted multidrug or homocysteine efflux system |
CCTATGGGGATATTGATTAAAAATATCCAGTGCCAGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACGGG > REL606/3901896‑3901966
|
cgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacag < 1:2364375‑M2/1‑1 (MQ=255)
tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGGt < 1:1204577‑M2/3‑1 (MQ=255)
tgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGGt < 1:2697924‑M2/3‑1 (MQ=255)
taactgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGcc < 1:24570‑M2/7‑1 (MQ=255)
taactgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGcc > 1:7447282‑M2/30‑36 (MQ=255)
aactgtccaactttttggggtcagtacaGGTTgcca > 1:6944651‑M2/29‑35 (MQ=255)
aactgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGccc < 1:1530738‑M2/8‑1 (MQ=255)
aactgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGccc > 1:3832823‑M2/29‑36 (MQ=255)
aactgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGccc > 1:3425479‑M2/29‑36 (MQ=255)
actgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGCCCa > 1:6861061‑M2/28‑36 (MQ=255)
actgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGCCCa < 1:3216303‑M2/9‑1 (MQ=255)
ctgtccaactttttggggtcagtacaGGTTGCCCAg < 1:6193507‑M2/10‑1 (MQ=255)
gtccaactttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGt > 1:4716605‑M2/25‑36 (MQ=255)
tccaactttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTg < 1:6601788‑M2/13‑1 (MQ=255)
tccaactttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTg < 1:1182490‑M2/13‑1 (MQ=255)
aactttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGAcc < 1:3280724‑M2/16‑1 (MQ=255)
ctttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAg > 1:880125‑M2/19‑36 (MQ=255)
tttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGc > 1:2898066‑M2/18‑36 (MQ=255)
tttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGc < 1:2095577‑M2/19‑1 (MQ=255)
ttttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCa < 1:934093‑M2/20‑1 (MQ=255)
tttggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAc < 1:2344073‑M2/21‑1 (MQ=255)
tggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGATCAGCAcgc < 1:5586980‑M2/23‑1 (MQ=255)
tggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAcgc < 1:178612‑M2/23‑1 (MQ=255)
tggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAcgc > 1:6120011‑M2/14‑36 (MQ=255)
ggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAcgcc < 1:4938404‑M2/24‑1 (MQ=255)
ggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAcgcc < 1:2951071‑M2/24‑1 (MQ=255)
ggggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAcgcc > 1:7129715‑M2/13‑36 (MQ=255)
gggtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCAcgccg > 1:6339565‑M2/12‑36 (MQ=255)
gtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACgccgcc < 1:3540023‑M2/27‑1 (MQ=255)
gtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACgccgcc < 1:6410723‑M2/27‑1 (MQ=255)
gtcagtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACgccgcc > 1:5843826‑M2/10‑36 (MQ=255)
agtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAg < 1:4545028‑M2/30‑1 (MQ=255)
agtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAg < 1:4306323‑M2/30‑1 (MQ=255)
agtacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAg < 1:4718499‑M2/30‑1 (MQ=255)
tacaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGaa > 1:3241821‑M2/5‑36 (MQ=255)
acaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAAc > 1:4986518‑M2/4‑36 (MQ=255)
acaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAAc > 1:7877541‑M2/4‑36 (MQ=255)
acaGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAAc < 1:4427222‑M2/33‑1 (MQ=255)
caGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACg < 1:4312572‑M2/34‑1 (MQ=255)
caGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACg > 1:5133658‑M2/3‑36 (MQ=255)
aGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACgg > 1:3999297‑M2/2‑36 (MQ=255)
aGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACgg < 1:5549332‑M2/35‑1 (MQ=255)
GGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACggg > 1:4611561‑M2/1‑36 (MQ=255)
GGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACggg > 1:6005133‑M2/1‑36 (MQ=255)
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CCTATGGGGATATTGATTAAAAATATCCAGTGCCAGGTTGCCCAGGTGACCAGCACGCCGCCAAGAACGGG > REL606/3901896‑3901966
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 37 ≤
ATCG
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