Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA REL606 3,483,047 C→A 100% R455S (CGC→AGC)  malT → transcriptional regulator MalT

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL6063,483,0470C→A100.0% 199.1 551363malTtranscriptional regulator MalT
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (30/25):  ref base (0/0):  total (30/25)

GAAGACACCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGCGCGCCCAGGTGGCGATTAACGATGGTAATCCG  >  REL606/3483014‑3483079
                                 |                                
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   gaCACCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGAGCGcc                             >  1:396057/1‑36 (MQ=255)
   gaCACCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGAGCGcc                             <  1:6162010/36‑1 (MQ=255)
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    acacCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGAGCGccc                            <  1:7772919/36‑1 (MQ=255)
    acacCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGAGCGccc                            <  1:5520635/36‑1 (MQ=255)
    acacCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGAGCGccc                            >  1:5808085/1‑36 (MQ=255)
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         aTGCACGCAGAATTTAACGCTCTGAGCGCCCAGGTg                       <  1:800678/36‑1 (MQ=255)
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                              ctGAGCGCCCAGGTGGCGATTAACGATGGTAATCCg  <  1:1028612/36‑1 (MQ=255)
                                 |                                
GAAGACACCATGCACGCAGAATTTAACGCTCTGCGCGCCCAGGTGGCGATTAACGATGGTAATCCG  >  REL606/3483014‑3483079

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 18 ≤  ATCG  < 25 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG