Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
MC JC | REL606 | 547,700 | Δ8,224 bp | 100% | IS1‑mediated | [nmpC]–[ECB_00513] | [nmpC], ybcR, ybcS, ybcT, ybcU, ECB_00510, nohB, ECB_00512, [ECB_00513] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 546958–547700 | 555923–555877 | 8178–8966 | 17 [14] | [0] 105 | [insB‑6]–[ECB_00513] | [insB‑6], insA‑6, nmpC, ybcR, ybcS, ybcT, ybcU, ECB_00510, nohB, ECB_00512, [ECB_00513] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 555924 = | 0 (0.000) | 60 (1.120) | 39/62 | NT | 100% | coding (1209/2346 nt) | ECB_00513 | conserved hypothetical protein |
? | REL606 | = 2035093 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
CCTGATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTG................................... < REL606/555962‑555924
...................................TTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < REL606/2035093‑2035059
ATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGG > 1:7595119/1‑36 (MQ=1)
ATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGG > 1:7494102/1‑36 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT > 1:6333627/1‑36 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT > 1:3052510/1‑36 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT < 1:4359470/36‑1 (MQ=1)
TATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTG > 1:5523639/1‑36 (MQ=1)
TATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTG < 1:2763463/36‑1 (MQ=1)
TATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTG > 1:2474774/1‑36 (MQ=1)
TATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTG < 1:5388516/36‑1 (MQ=1)
ATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGA < 1:6749529/36‑1 (MQ=1)
ATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGA > 1:4750557/1‑36 (MQ=1)
ATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGA < 1:7753631/36‑1 (MQ=1)
TAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATG > 1:2280401/1‑36 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC < 1:4983379/36‑1 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC < 1:5995560/36‑1 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC > 1:2940324/1‑36 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC > 1:6303298/1‑36 (MQ=1)
ATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCT < 1:2932644/36‑1 (MQ=1)
TGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTG > 1:929313/1‑36 (MQ=1)
TGTATGTTGCACCTGATGCGCGGTTGGGTGATGCTG < 1:5905090/36‑1 (MQ=0)
GTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGC > 1:5500129/1‑36 (MQ=1)
GTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGC > 1:6732598/1‑36 (MQ=1)
GTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGC > 1:1372197/1‑36 (MQ=1)
TATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC < 1:1690029/36‑1 (MQ=1)
TATGGTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC < 1:5175186/36‑1 (MQ=0)
ATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCA < 1:2907091/36‑1 (MQ=1)
ATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCA < 1:1947148/36‑1 (MQ=1)
TGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAA < 1:410424/36‑1 (MQ=1)
GTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAAC > 1:1690125/1‑36 (MQ=1)
TTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACT > 1:6426746/1‑36 (MQ=1)
TTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACT < 1:6783772/36‑1 (MQ=1)
TTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACT < 1:1520159/36‑1 (MQ=1)
TTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACT < 1:1380728/36‑1 (MQ=1)
TGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:6746416/1‑36 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:950636/36‑1 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:2189957/36‑1 (MQ=1)
CACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:4690790/36‑1 (MQ=1)
CACCTGATGCGCGTTTCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:2759949/1‑36 (MQ=38)
ACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:4906011/36‑1 (MQ=1)
ACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:4655251/1‑36 (MQ=1)
ACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:2467166/36‑1 (MQ=1)
CCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:3159885/36‑1 (MQ=1)
CCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:3892727/1‑36 (MQ=1)
TGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:1321356/1‑36 (MQ=1)
TGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:7040273/36‑1 (MQ=1)
TGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:74091/36‑1 (MQ=1)
GATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:2077964/1‑36 (MQ=1)
GATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:5472432/36‑1 (MQ=1)
ATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:4400150/36‑1 (MQ=1)
TGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:3955454/36‑1 (MQ=1)
TGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:4010806/36‑1 (MQ=1)
TGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:4044959/1‑36 (MQ=1)
GCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:3393072/36‑1 (MQ=1)
GCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:6115669/36‑1 (MQ=1)
CGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:1801292/1‑36 (MQ=1)
GCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:1301525/1‑36 (MQ=1)
GCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:1974560/36‑1 (MQ=1)
GCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:2566308/1‑36 (MQ=1)
GCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:4766599/1‑36 (MQ=1)
GTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:1071359/1‑36 (MQ=1)
CCTGATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTG................................... < REL606/555962‑555924
...................................TTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < REL606/2035093‑2035059
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 37 ≤
ATCG
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