New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 = 16728NA (NA)26 (0.680) 19/60 NT 81.2% noncoding (1343/1343 nt) IS186 repeat region
?REL606 2713428 = 6 (0.130)noncoding (77/93 nt) serV tRNA‑Ser

TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT...................................  >  REL606/16694‑16728
................................GGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCC  >  REL606/2713428‑2713464
                                                                        
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    >  1:4649009/1‑36 (MQ=1)
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    <  1:4065111/36‑1 (MQ=1)
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    >  1:3984910/1‑36 (MQ=1)
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    <  1:3219038/36‑1 (MQ=1)
   GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTC                                   <  1:3547216/36‑1 (MQ=1)
    ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCG                                  >  1:1089676/1‑36 (MQ=1)
     TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGA                                 <  1:3503536/36‑1 (MQ=1)
      ggcTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAA                                >  1:520245/4‑36 (MQ=0)
      GGTTCACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAA                                <  1:1896529/36‑1 (MQ=0)
      GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAA                                <  1:303236/36‑1 (MQ=1)
       GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAAC                               >  1:4697022/1‑36 (MQ=1)
        TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACC                              <  1:288610/36‑1 (MQ=1)
           AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCG                           >  1:3958077/1‑36 (MQ=1)
            ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGG                          >  1:1617944/1‑36 (MQ=1)
             CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGA                         <  1:534183/36‑1 (MQ=1)
              CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGAT                        >  1:1663129/1‑36 (MQ=1)
              CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGAT                        <  1:560613/36‑1 (MQ=1)
                 TAATTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCA                     <  1:1406782/36‑1 (MQ=0)
                  AAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAG                    >  1:4906171/1‑36 (MQ=1)
                   AGTTAGCGCTTATGGGATTCGACCCCCGGATGCAGC                   <  1:5369947/36‑1 (MQ=0)
                   AGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGC                   >  1:1262190/1‑36 (MQ=1)
                      cAGCGCTTATGGGCTTCGAACCCCGGATGCAGCTTT                <  1:89715/35‑1 (MQ=0)
                       AGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTT               <  1:5404389/36‑1 (MQ=1)
                       AGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTT               <  1:809709/36‑1 (MQ=1)
                           CTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACC           <  1:4043771/36‑1 (MQ=1)
                           CTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACC           <  1:1510695/36‑1 (MQ=1)
                                                                        
TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT...................................  >  REL606/16694‑16728
................................GGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCC  >  REL606/2713428‑2713464

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 12 ≤  ATCG  < 21 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG