New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 = 70145436 (0.600)9 (0.150) 5/68 NT 32.7% coding (1102/2199 nt) speF ornithine decarboxylase isozyme, inducible
?REL606 2039202 = 1 (0.020)coding (493/747 nt) wbbA putative glycosyltransferase WbbA

TAACGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGCCTGTT  >  REL606/701420‑701489
                                  |                                   
tAACGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTa                                    <  1:157017/36‑1 (MQ=255)
 aaCGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTTTTTTTTtt                                   >  1:5280768‑M1/1‑34 (MQ=255)
 aaCGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTAt                                   <  1:6042761/36‑1 (MQ=255)
 aaCGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTAt                                   <  1:5010591/36‑1 (MQ=255)
 aaCGCTGTTGCACTTTGATGTGGCTGTGtttttttt                                   >  1:1661187/1‑34 (MQ=37)
  aCGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGGTttttttttt                                  >  1:2007544/1‑33 (MQ=25)
   cGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTttta                                 >  1:8394518‑M1/1‑32 (MQ=255)
    gCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTGTTTTTTttttt                                >  1:2809323‑M1/1‑31 (MQ=255)
     cTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTtttaat                               >  1:4725215‑M1/1‑30 (MQ=255)
       gTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAAttt                             <  1:2516059/36‑1 (MQ=255)
        ttGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTttttttttt                            >  1:6085571‑M1/1‑27 (MQ=255)
        ttGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTttttatttt                            >  1:6691881‑M1/1‑27 (MQ=255)
        ttGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTttttatttt                            >  1:8373819‑M1/1‑27 (MQ=255)
        ttGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTtg                            <  1:2679031/36‑1 (MQ=255)
        ttGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTtg                            <  1:2850802/36‑1 (MQ=255)
         tGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTtgt                           <  1:1409920/36‑1 (MQ=255)
          gCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTttttatttttt                          >  1:2623057‑M1/1‑25 (MQ=255)
          gCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTtgtt                          <  1:5510178/36‑2 (MQ=255)
          gCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTtgtg                          <  1:5907411/36‑1 (MQ=255)
            ccTTTGATGTGTCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGaa                        <  1:6567574/36‑1 (MQ=255)
            ccTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGaa                        <  1:4862936/36‑1 (MQ=255)
             cTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTttttatttttttat                       >  1:3523574‑M1/1‑22 (MQ=255)
             cTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAg                       <  1:8055083/36‑1 (MQ=255)
               ttGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTc                     <  1:1797115/36‑1 (MQ=255)
               ttGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTc                     <  1:3220497/36‑1 (MQ=255)
                tGATGTGGCTGTCTTTTTTTTTAATTTTTTAAGtat                    >  1:6170919/1‑34 (MQ=16)
                tGATGTGGCTGTCTTTTTTTTTAATTTTTGAAGttt                    >  1:7788589/1‑34 (MQ=25)
                  aTGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCtta                  >  1:1829951/1‑34 (MQ=255)
                  aTGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTga                  <  1:4545660/36‑1 (MQ=255)
                  aTGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTga                  <  1:7290779/36‑1 (MQ=255)
                   tgtgGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTgag                 <  1:6964700/36‑1 (MQ=255)
                     tgGCTGTCTTTTTTATGCATTTTTGAAGTCTGTGaa               >  1:2671960/1‑36 (MQ=25)
                     tgGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGaa               <  1:7113198/36‑1 (MQ=255)
                       gCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGaaaa             <  1:2056122/36‑1 (MQ=255)
                        cTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGaaaaa            <  1:5916158/36‑1 (MQ=255)
                        cTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGaaaaa            >  1:3356226/1‑36 (MQ=255)
                        cTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGaaaaa            <  1:1035423/36‑1 (MQ=255)
                         tGTCTTTTTTATGAATTTGTGATGTCTGAGataaat           >  1:7524499/1‑35 (MQ=25)
                         tGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAAc           >  1:4616509/1‑36 (MQ=255)
                           tCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCa         <  1:8117350/36‑1 (MQ=255)
                            cTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAg        >  1:7314295/1‑36 (MQ=255)
                            cTTTTTTATGAATTCGTGAAGTCTGAGAAAAACCAg        <  1:7301646/36‑1 (MQ=255)
                              tttttATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGcc      <  1:4906091/36‑1 (MQ=255)
                              tttttATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGcc      <  1:3146029/36‑1 (MQ=255)
                               ttttATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGCCt     >  1:6351122/1‑36 (MQ=255)
                                tttATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGCCtg    <  1:297123/36‑1 (MQ=255)
                                tttATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGCCtg    >  1:8116034/1‑36 (MQ=255)
                                  tATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGCCtgtt  >  1:5914209/1‑36 (MQ=255)
                                  |                                   
TAACGCTGTTGCCCTTTGATGTGGCTGTCTTTTTTATGAATTTGTGAAGTCTGAGAAAAACCAGCCTGTT  >  REL606/701420‑701489

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 10 ≤  ATCG  < 24 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG