New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 = 16728NA (NA)37 (0.700) 27/60 NT 51.4% noncoding (1343/1343 nt) IS186 repeat region
?REL606 2713428 = 35 (0.570)noncoding (77/93 nt) serV tRNA‑Ser

TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT...................................  >  REL606/16694‑16728
................................GGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCC  >  REL606/2713428‑2713464
                                                                        
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    <  1:6652799/36‑1 (MQ=1)
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    >  1:5801394/1‑36 (MQ=1)
  AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATT                                    <  1:2279077/36‑1 (MQ=1)
   GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTC                                   <  1:8023792/36‑1 (MQ=1)
   GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTC                                   <  1:7027319/36‑1 (MQ=1)
   GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTC                                   <  1:5000718/36‑1 (MQ=1)
   GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTC                                   >  1:3166461/1‑36 (MQ=1)
    ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCG                                  <  1:3853085/36‑1 (MQ=1)
     TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGA                                 <  1:5653750/36‑1 (MQ=1)
      GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAA                                <  1:7203528/36‑1 (MQ=1)
       GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAAC                               >  1:436628/1‑36 (MQ=1)
        TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACC                              >  1:391833/1‑36 (MQ=1)
         TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCC                             <  1:1786541/36‑1 (MQ=1)
          CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCC                            >  1:3687097/1‑36 (MQ=1)
          CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCC                            >  1:2657621/1‑36 (MQ=1)
           AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCG                           >  1:7495376/1‑36 (MQ=1)
              CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGAT                        >  1:3949907/1‑36 (MQ=1)
              CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGAT                        >  1:4297385/1‑36 (MQ=1)
                TTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGC                      <  1:4143615/36‑1 (MQ=1)
                  AAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAG                    >  1:8336647/1‑36 (MQ=1)
                  AAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAG                    >  1:32750/1‑36 (MQ=1)
                  AAGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAG                    <  1:5319647/36‑1 (MQ=1)
                   AGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGC                   <  1:6845184/36‑1 (MQ=1)
                   AGTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGC                   <  1:2892769/36‑1 (MQ=1)
                    GTTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCT                  <  1:6471454/36‑1 (MQ=1)
                     TTAGCGCTTATGGTATTCGAACCCCGGATGCAGCTT                 <  1:95456/36‑1 (MQ=0)
                     TTAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTT                 <  1:1418350/36‑1 (MQ=1)
                      TAGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTT                <  1:5269143/36‑1 (MQ=1)
                       AGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTT               >  1:6998041/1‑36 (MQ=1)
                       AGCGCTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTT               >  1:1167295/1‑36 (MQ=1)
                           CTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACC           <  1:7517983/36‑1 (MQ=1)
                           CTTATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCCTTTGACC           >  1:6286547/1‑36 (MQ=0)
                             TATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGC         <  1:5039287/36‑1 (MQ=1)
                             TATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGC         <  1:7268517/36‑1 (MQ=1)
                             TATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGC         >  1:1399271/1‑36 (MQ=1)
                              ATGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCA        <  1:3782967/36‑1 (MQ=1)
                               TGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCAT       <  1:1762807/36‑1 (MQ=1)
                                                                        
TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT...................................  >  REL606/16694‑16728
................................GGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCC  >  REL606/2713428‑2713464

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 17 ≤  ATCG  < 25 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG