Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA REL606 430,835 C→T 100% intergenic (‑48/‑108) insL‑2 ← / → lon putative transposase insL for insertion sequence IS186/DNA‑binding ATP‑dependent protease La

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  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL606430,8350C→T100.0% 99.2 32intergenic (‑48/‑108)insL‑2/lonputative transposase insL for insertion sequence IS186/DNA‑binding ATP‑dependent protease La
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (15/15):  ref base (1/0):  total (16/16)

GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGT  >  REL606/430811‑430867
                        |                                
gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGa                       >  1:325064/1‑36 (MQ=12)
gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGa                       >  1:453490/1‑36 (MQ=12)
gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGa                       >  1:1306844/1‑36 (MQ=12)
gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGa                       <  1:5240690/36‑1 (MQ=12)
gTAATACCACAAACCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGa                       >  1:1254612/1‑36 (MQ=11)
 tAATACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGaa                      <  1:1898038/36‑1 (MQ=255)
  aaTACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGaaa                     >  1:899691/1‑36 (MQ=255)
  aaTACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGCGGaaa                     >  1:4810704/1‑36 (MQ=14)
  aaTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgtggctt                     >  1:4660902/1‑33 (MQ=1)
    tACCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACa                   >  1:3195063/1‑36 (MQ=255)
     aCCACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACAt                  >  1:1634204/1‑36 (MQ=255)
      ccACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATc                 >  1:5726816/1‑36 (MQ=255)
      ccACAACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATc                 <  1:269134/36‑1 (MQ=255)
       cacaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATcc                <  1:1337426/36‑1 (MQ=255)
       cacaACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATcc                >  1:2414552/1‑36 (MQ=255)
         caACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATcccc              >  1:4077588/1‑36 (MQ=255)
         caACCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATcccc              <  1:3550581/36‑1 (MQ=255)
         caACCCTTAAGTTAG.TCCTATGGGGAAACATCCCCa             <  1:5522447/36‑1 (MQ=21)
          aaCCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCa             <  1:3009016/36‑1 (MQ=255)
          aaCCCTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCa             >  1:1013819/1‑36 (MQ=255)
            cccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCata           <  1:4676172/36‑1 (MQ=255)
            cccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCata           <  1:1540973/36‑1 (MQ=255)
             ccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCatat          >  1:1524593/1‑36 (MQ=255)
             ccTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCatat          <  1:953921/36‑1 (MQ=255)
              cTTAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCAtata         <  1:2328690/36‑1 (MQ=255)
                tAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACt       <  1:3887125/36‑1 (MQ=255)
                tAAGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACt       <  1:1860019/36‑1 (MQ=255)
                 aaGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTg      <  1:3001214/36‑1 (MQ=255)
                 aaGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTg      >  1:1504552/1‑36 (MQ=255)
                 aaGTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTg      <  1:1052994/36‑1 (MQ=255)
                   gTTAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGAc    <  1:5042509/36‑1 (MQ=255)
                     tAGTGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACgc  >  1:4185594/1‑35 (MQ=255)
                        |                                
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGT  >  REL606/430811‑430867

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 13 ≤  ATCG  < 22 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG