Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL6063,250,9111.→C 3.8% 8.2 0.0 ‑0.680coding (338/2673 nt)infBtranslation initiation factor IF‑2
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands.
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (1/2):  ref base (28/49):  total (29/51)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.45e-01

TAGCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCAAG  >  REL606/3250876‑3250945
                                    |                                  
tAGCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTTtt                                     >  1:5582875/1‑36 (MQ=255)
tAGCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCtt                                     <  1:4785455/36‑1 (MQ=255)
 aGCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.c                                   >  1:7353994/1‑36 (MQ=255)
  gCCGATTCTTCTGCCTCACGAGCGGCTTGCTCTT.cc                                  >  1:3425986/1‑36 (MQ=38)
  gCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.cc                                  >  1:2408075/1‑36 (MQ=255)
  gCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.cc                                  >  1:3419025/1‑36 (MQ=255)
  gCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTATT.cc                                  >  1:4818347/1‑36 (MQ=255)
  gCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGATTGATCCT.cc                                  >  1:1535427/1‑36 (MQ=25)
   ccGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCg                                 >  1:7483562/1‑36 (MQ=255)
   ccGATTCTTCTGCCTCACGACGCGCTTGCTCTT.CCg                                 >  1:2831740/1‑36 (MQ=255)
    ctaTTCTTCTCCCTCACTCCGTGCTTGCTCTT.CCGc                                <  1:3735958/34‑1 (MQ=16)
    cGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGc                                <  1:3828570/36‑1 (MQ=255)
    cGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGc                                >  1:6915577/1‑36 (MQ=255)
    cGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGc                                <  1:4215646/36‑1 (MQ=255)
     gATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCt                               <  1:3795685/36‑1 (MQ=255)
     gATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCt                               >  1:7510967/1‑36 (MQ=255)
     gATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCt                               >  1:6470664/1‑36 (MQ=255)
     gATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCt                               <  1:1290410/36‑1 (MQ=255)
     gATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCt                               <  1:5069816/36‑1 (MQ=255)
     gATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCCCt                               >  1:958871/1‑36 (MQ=255)
       ttcttcTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTc                             <  1:5885741/36‑1 (MQ=255)
       ttcttcTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTc                             <  1:241584/36‑1 (MQ=255)
        tcttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCa                            >  1:7689356/1‑36 (MQ=255)
        tcttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCa                            <  1:7219587/36‑1 (MQ=255)
        tcttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCa                            <  1:7763018/36‑1 (MQ=255)
        tcctctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTTCCCGCTTc                             <  1:5074891/33‑1 (MQ=37)
         cttctGCCTCACGACGTGCTTGCTCTT.CCGCTTCAc                           <  1:7122919/36‑1 (MQ=255)
         cttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCAc                           <  1:5888761/36‑1 (MQ=255)
         cttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCAc                           <  1:2558287/36‑1 (MQ=255)
         cttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCAc                           <  1:2005987/36‑1 (MQ=255)
          ttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACg                          >  1:640061/1‑36 (MQ=255)
          ttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACg                          >  1:3839666/1‑36 (MQ=255)
          ttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACg                          >  1:4839489/1‑36 (MQ=255)
          ttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACg                          <  1:1973101/36‑1 (MQ=255)
          ttctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACg                          <  1:3059226/36‑1 (MQ=255)
           tctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCTCTTCACGc                         >  1:3104628/1‑36 (MQ=255)
           tctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGc                         >  1:7075454/1‑36 (MQ=255)
           tctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGc                         <  1:7742760/36‑1 (MQ=255)
           tctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGc                         <  1:1236130/36‑1 (MQ=255)
            ctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCt                        <  1:1513204/36‑1 (MQ=255)
            ctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCt                        <  1:5148083/36‑1 (MQ=255)
            ctGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCt                        <  1:4543737/36‑1 (MQ=255)
             tGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTg                       <  1:3441645/36‑1 (MQ=255)
              gCCTCACGACGGGCTTGCTCTTCCCGCTTCACGCTg                       >  1:1849386/1‑36 (MQ=38)
              gCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTgc                      <  1:5228171/36‑1 (MQ=255)
              gCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTgc                      <  1:1464785/36‑1 (MQ=255)
               ccTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTgcg                     <  1:4937786/36‑1 (MQ=255)
                 tCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCt                   <  1:4319081/36‑1 (MQ=255)
                 tCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCt                   <  1:3557345/36‑1 (MQ=255)
                 tCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCt                   >  1:2203178/1‑36 (MQ=255)
                 tCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCt                   <  1:2551877/36‑1 (MQ=255)
                 tCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCt                   <  1:7287396/36‑1 (MQ=255)
                  cACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCtt                  <  1:4620560/36‑1 (MQ=255)
                  cACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCtt                  >  1:5853248/1‑36 (MQ=255)
                  cACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCtt                  <  1:5551653/36‑1 (MQ=255)
                   acgacgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTg                 <  1:2970324/36‑1 (MQ=255)
                    cgacgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCAAGCTGCGCTTGc                >  1:7639371/1‑36 (MQ=255)
                    cgacgGGCTTGCTCTT.CCACTTCACGCTGCGCtttc                >  1:1170048/1‑34 (MQ=37)
                     gacgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGct               <  1:172020/36‑1 (MQ=255)
                     gacgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGct               <  1:6777206/36‑1 (MQ=255)
                     gacgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGct               <  1:4135597/36‑1 (MQ=255)
                      acgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGctc              <  1:7462759/36‑1 (MQ=255)
                      acgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGctc              >  1:3169832/1‑36 (MQ=255)
                      acgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGctc              >  1:5203612/1‑36 (MQ=255)
                       cgGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGctct             <  1:2548570/36‑1 (MQ=255)
                        gggCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCtt            >  1:1530361/1‑36 (MQ=255)
                         ggCTTGCTCTTCCCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCtt            <  1:7799056/36‑1 (MQ=37)
                         ggCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTc           <  1:3902656/36‑1 (MQ=255)
                         ggCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTc           >  1:7118200/1‑36 (MQ=255)
                         ggCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTc           <  1:5057916/36‑1 (MQ=255)
                         ggCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTc           >  1:7366721/1‑36 (MQ=255)
                          gCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTcc          <  1:1220360/36‑1 (MQ=255)
                          gCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTcc          >  1:4076119/1‑36 (MQ=255)
                          gCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTcc          <  1:385720/36‑1 (MQ=255)
                            ttactctT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGc        <  1:98168/33‑1 (MQ=255)
                            ttGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGc        >  1:7154409/1‑36 (MQ=255)
                            ttGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGc        >  1:1809527/1‑36 (MQ=255)
                            ttGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGc        <  1:5070147/36‑1 (MQ=255)
                            ttGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGc        <  1:841116/36‑1 (MQ=255)
                            ttGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGc        >  1:6256815/1‑36 (MQ=255)
                             tGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCt       <  1:3560843/36‑1 (MQ=255)
                             tGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCt       <  1:602806/36‑1 (MQ=255)
                              gCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGTTg      >  1:763687/1‑36 (MQ=255)
                               ctctT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGc     <  1:4909334/36‑1 (MQ=255)
                               ctctT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGc     <  1:4646932/36‑1 (MQ=255)
                                tctT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCa    >  1:6337293/1‑36 (MQ=255)
                                 ctT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCaa   <  1:2285321/36‑1 (MQ=255)
                                 ctT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCaa   >  1:2273677/1‑36 (MQ=255)
                                  tt.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCAAg  >  1:481186/1‑36 (MQ=255)
                                  tt.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCAAg  >  1:7919152/1‑36 (MQ=255)
                                  tt.CCGCTTCACGCTACTCTTGCTCTTCCGCTGCAAg  <  1:1184184/36‑1 (MQ=37)
                                    |                                  
TAGCCGATTCTTCTGCCTCACGACGGGCTTGCTCTT.CCGCTTCACGCTGCGCTTGCTCTTCCGCTGCAAG  >  REL606/3250876‑3250945

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 13 ≤  ATCG  < 22 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG