Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL6062,760,7310C→T16.2% 12.6 ‑19.6 0.0101770ygbNpredicted transporter
Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism.
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (18/0):  ref base (22/61):  total (40/61)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.04e-09
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

TATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTG  >  REL606/2760696‑2760766
                                   |                                   
tATTCCTATCGCGATTATCATGGTGGGTACGGTTTc                                     <  1:8270445/36‑1 (MQ=255)
tATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTc                                     <  1:1622968/36‑1 (MQ=255)
 aTTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTcc                                    <  1:8270727/36‑1 (MQ=255)
 aTTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTcc                                    <  1:8170747/36‑1 (MQ=255)
 aTTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTcc                                    <  1:5881080/36‑1 (MQ=255)
 aTTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTcc                                    <  1:4190497/36‑1 (MQ=255)
  ttCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTTCg                                   >  1:5146530/1‑36 (MQ=255)
  ttCCTATCGCGATTATCATGGCGGGGAAGGTTTTCg                                   >  1:784281/1‑36 (MQ=21)
  gtCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTATGGGTTTCg                                   >  1:7977881/2‑36 (MQ=21)
   tCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGc                                  <  1:2470677/36‑1 (MQ=255)
   tCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTAAGGGTTTCGc                                  >  1:1299341/1‑36 (MQ=25)
   tCCTATCGCGATTATCATGGCGGGGACGGTTTTCGc                                  >  1:3517460/1‑36 (MQ=37)
     cTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCaa                                <  1:4098921/36‑1 (MQ=255)
      tATCGCGATTATTATGGCTGGTACGGTTTCCGCAac                               <  1:4226089/36‑1 (MQ=37)
      tATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAac                               <  1:6164419/36‑1 (MQ=255)
      tATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAac                               <  1:4776167/36‑1 (MQ=255)
      tATCGCGATTATCATGGCGGGGAAGGTTTTCGCCac                               >  1:4433089/1‑36 (MQ=16)
       aTCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTTCGCAaca                              >  1:582802/1‑36 (MQ=255)
        tCGCGATTATCATGGCGGGTACGGGTTTCTCCacac                             >  1:6029697/1‑36 (MQ=16)
         cgcgATTATCATGGCGGGTACGGTTTTCGCCacaat                            >  1:5080652/1‑34 (MQ=25)
         cgcgATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACt                            <  1:8159824/36‑1 (MQ=255)
         cgcgATTATCATGGCGGGGACGGGTTTCGCAACACt                            >  1:6535592/1‑36 (MQ=25)
          gcgATTATCATGGCGGGTACGGTTTTCGCAacacat                           >  1:2194170/1‑34 (MQ=37)
          gcgATTATCATGGCGGGGTAGGTTTTCGCAACACTg                           >  1:1701675/1‑36 (MQ=19)
          gcgATTATCATGGCGGGGACGGTTTTCGCCacaccg                           >  1:7432449/1‑34 (MQ=21)
          gcgATTATCATGGCGGGCGCGGGTTTCGCCacaccg                           >  1:6750473/1‑34 (MQ=9)
           cgATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGa                          <  1:6098606/36‑1 (MQ=255)
           cgATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGa                          <  1:5135776/36‑1 (MQ=255)
             aTTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATg                        <  1:3004796/36‑1 (MQ=255)
             aTTATCATGGCGGGGACGGGTTTCGCAAAACTTATg                        >  1:2436077/1‑36 (MQ=16)
              ttATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgc                       <  1:3650938/36‑1 (MQ=255)
               tATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgcc                      <  1:4110692/36‑1 (MQ=255)
               tATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgcc                      <  1:800310/36‑1 (MQ=255)
               tATCATGGCGGGGACGGGTTTCTCAACACCGATgcc                      >  1:5230053/1‑36 (MQ=12)
                aTCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgccg                     <  1:4468072/36‑1 (MQ=255)
                aTCATGGCGGGGGCGGGTTCCGAAAAAATGATtccc                     >  1:1834507/1‑35 (MQ=2)
                 tCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgccgc                    <  1:1194344/36‑1 (MQ=255)
                 tCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgccgc                    <  1:7186704/36‑1 (MQ=255)
                  cATGGCGGGTACGGTTTTCGCCAAACTTATgccgcc                   >  1:490677/1‑36 (MQ=16)
                  cATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgccgcc                   <  1:3709731/36‑1 (MQ=255)
                  cATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATgccgcc                   <  1:7773401/36‑1 (MQ=255)
                   acggCGGGTACGGTTTCCGCACCACTGATGCCGCCt                  <  1:4077942/34‑1 (MQ=37)
                   aTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCt                  <  1:1920870/36‑1 (MQ=255)
                   aTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCt                  <  1:1331999/36‑1 (MQ=255)
                   aTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCt                  <  1:510197/36‑1 (MQ=255)
                   aTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCt                  <  1:3404044/36‑1 (MQ=255)
                   aTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCt                  <  1:6564630/36‑1 (MQ=255)
                   aTGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCt                  <  1:6040880/36‑1 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 <  1:6758223/36‑1 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 >  1:731589/1‑36 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 >  1:6717041/1‑36 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 <  1:5451267/36‑1 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 <  1:5789033/36‑1 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 <  1:2198187/36‑1 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 <  1:2773846/36‑1 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 >  1:2932865/1‑36 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 >  1:317153/1‑36 (MQ=255)
                    tGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCtt                 >  1:3999485/1‑36 (MQ=255)
                     ggCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTc                <  1:8021999/36‑1 (MQ=255)
                     ggCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTc                <  1:1608787/36‑1 (MQ=255)
                     ggCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTc                >  1:2726735/1‑36 (MQ=255)
                     ggCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTc                <  1:4788538/36‑1 (MQ=255)
                     ggCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTc                >  1:1961830/1‑36 (MQ=255)
                     ggCGGGTACGGTTTCCGCAACACTAATGCCGCCTTc                >  1:2308576/1‑36 (MQ=255)
                      gCGGGTACGGTTTCCGCAATACTGATGCCGCCTTCg               >  1:8023902/1‑36 (MQ=255)
                      gCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCg               <  1:1995598/36‑1 (MQ=255)
                      gCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCg               >  1:6847918/1‑36 (MQ=255)
                      gCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCg               <  1:2071304/36‑1 (MQ=255)
                      gCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCg               <  1:4025687/36‑1 (MQ=255)
                       cGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGc              <  1:7112037/36‑1 (MQ=255)
                        ctgTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCa             <  1:6698142/34‑1 (MQ=255)
                         ggTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCAt            <  1:175298/36‑1 (MQ=255)
                         ggTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCAt            <  1:3546168/36‑1 (MQ=255)
                         ggTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCAt            <  1:6382979/36‑1 (MQ=255)
                          gTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATc           >  1:1192837/1‑36 (MQ=255)
                           tACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATcc          <  1:1183075/36‑1 (MQ=255)
                           tACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATcc          <  1:7511856/36‑1 (MQ=255)
                           tACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATcc          <  1:3619209/36‑1 (MQ=255)
                            aCGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATccc         <  1:3162644/36‑1 (MQ=255)
                            aCGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATccc         <  1:6497155/36‑1 (MQ=255)
                            aCGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATccc         <  1:2047894/36‑1 (MQ=255)
                             cGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATcccc        <  1:275542/36‑1 (MQ=255)
                              ggTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCt       >  1:356521/1‑36 (MQ=255)
                              ggTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCt       <  1:3561502/36‑1 (MQ=255)
                              ggTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCt       <  1:7914279/36‑1 (MQ=255)
                              ggTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCt       >  1:4168601/1‑36 (MQ=255)
                               gTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTg      >  1:6160968/1‑36 (MQ=255)
                               gTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTg      >  1:7678402/1‑36 (MQ=255)
                               gTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTg      <  1:3519437/36‑1 (MQ=255)
                                tttCCGCANCACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGc     <  1:5913166/36‑1 (MQ=255)
                                tttCCGCAACACTGATGCTGCCTTCGCATCCCCTGc     >  1:2830067/1‑36 (MQ=255)
                                tttCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGc     >  1:2314427/1‑36 (MQ=255)
                                tttCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGc     <  1:3617048/36‑1 (MQ=255)
                                tttCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGc     <  1:2288748/36‑1 (MQ=255)
                                tttCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGc     <  1:5720666/36‑1 (MQ=255)
                                 ttCCGCAACACTTATGCCTCCTTCGCATCCCCTGCt    <  1:6308284/36‑1 (MQ=38)
                                 ttCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCt    >  1:7958946/1‑36 (MQ=255)
                                  tCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCtt   <  1:5558579/36‑1 (MQ=255)
                                   ccGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTg  >  1:7720120/1‑36 (MQ=255)
                                   ccGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTg  <  1:8050355/36‑1 (MQ=255)
                                   |                                   
TATTCCTATCGCGATTATCATGGCGGGTACGGTTTCCGCAACACTGATGCCGCCTTCGCATCCCCTGCTTG  >  REL606/2760696‑2760766

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 6 ≤  ATCG  < 20 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG