Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
MC JC | REL606 | 547,700 | Δ8,224 bp | 100% | IS1‑mediated | [nmpC]–[ECB_00513] | [nmpC], ybcR, ybcS, ybcT, ybcU, ECB_00510, nohB, ECB_00512, [ECB_00513] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 546952–547700 | 555923–555877 | 8178–8972 | 24 [20] | [1] 87 | [insB‑6]–[ECB_00513] | [insB‑6], insA‑6, nmpC, ybcR, ybcS, ybcT, ybcU, ECB_00510, nohB, ECB_00512, [ECB_00513] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 555924 = | 1 (0.020) | 59 (1.080) | 34/62 | NT | 98.3% | coding (1209/2346 nt) | ECB_00513 | conserved hypothetical protein |
? | REL606 | = 2035093 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
CCTGATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTG................................... < REL606/555962‑555924
...................................TTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < REL606/2035093‑2035059
ATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGG > 1:4345663/1‑36 (MQ=1)
ATTTAGTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGG > 1:1763430/1‑36 (MQ=0)
TTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGG < 1:5744156/36‑1 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT > 1:1124218/1‑36 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT > 1:5905836/1‑36 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT > 1:2050442/1‑36 (MQ=1)
TTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGT > 1:2646675/1‑36 (MQ=1)
TATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTG < 1:1543643/36‑1 (MQ=1)
TTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGAT < 1:7735116/36‑1 (MQ=1)
TTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGAT > 1:2106613/1‑36 (MQ=1)
TAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATG < 1:6197517/36‑1 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC > 1:4238016/1‑36 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC < 1:5970938/36‑1 (MQ=1)
AATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGC > 1:495220/1‑36 (MQ=1)
ATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCT < 1:2174424/36‑1 (MQ=1)
ATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCT < 1:6463915/36‑1 (MQ=1)
ATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCT < 1:6894830/36‑1 (MQ=1)
GTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGC > 1:8434819/1‑36 (MQ=1)
TATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC < 1:4620746/36‑1 (MQ=1)
TATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC < 1:5038146/36‑1 (MQ=1)
TATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC < 1:2457432/36‑1 (MQ=1)
TATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC > 1:7213344/1‑36 (MQ=1)
TATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCC < 1:1016159/36‑1 (MQ=1)
ATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCA < 1:5399559/36‑1 (MQ=1)
ATGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCA > 1:4757901/1‑36 (MQ=1)
TGTTTCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAA < 1:885786/36‑1 (MQ=0)
TGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAA < 1:6695932/36‑1 (MQ=1)
TGTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAA > 1:3673814/1‑36 (MQ=1)
GTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAAC < 1:5720617/36‑1 (MQ=1)
GTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAAC < 1:7264574/36‑1 (MQ=1)
GTTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAAC < 1:4652621/36‑1 (MQ=1)
TTGCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACT < 1:8413599/36‑1 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:3738787/1‑36 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:550628/36‑1 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:5730491/1‑36 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:7714341/36‑1 (MQ=1)
GCACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:1862891/1‑36 (MQ=1)
CACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:5728958/36‑1 (MQ=1)
CACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:1305260/1‑36 (MQ=1)
CACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:7138902/1‑36 (MQ=1)
CACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:6838838/36‑1 (MQ=1)
ACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:7740360/1‑36 (MQ=1)
ACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:1150883/1‑36 (MQ=1)
ACCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:6143101/1‑36 (MQ=1)
CCTGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:5236137/1‑36 (MQ=1)
TGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:7245457/36‑1 (MQ=1)
TGATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:8204109/1‑36 (MQ=1)
GATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:2600843/36‑1 (MQ=1)
GATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:5185725/36‑1 (MQ=1)
ATGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:6125692/36‑1 (MQ=1)
TGCGCGTTTGTGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:6098238/36‑1 (MQ=0)
TGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:1797031/36‑1 (MQ=1)
TGCGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:8212636/36‑1 (MQ=1)
CGCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:2947633/36‑1 (MQ=1)
GCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:322216/36‑1 (MQ=1)
GCGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:4206068/36‑1 (MQ=1)
CGTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:925918/36‑1 (MQ=1)
CGTTTGGGTCATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:7071116/36‑1 (MQ=0)
GTTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:2053384/36‑1 (MQ=1)
CCTGATTTATTAATGTATGTTGCACCTGATGCGCGTTTG................................... < REL606/555962‑555924
...................................TTTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < REL606/2035093‑2035059
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 37 ≤
ATCG
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