New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 = 327811637 (0.620)6 (0.100) 6/70 NT 13.8% coding (46/576 nt) yrbK hypothetical protein
?REL606 4541608 = 38 (0.630)intergenic (‑14/‑236) yjiH/kptA conserved inner membrane protein/RNA 2'‑phosphotransferase‑like protein

CCAGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGCCGAAAA  >  REL606/3278081‑3278150
                                   |                                  
ccAGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCgg                                    <  1:5338214/36‑1 (MQ=255)
 cAGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGt                                   >  1:1479888/1‑36 (MQ=255)
 cAGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGt                                   <  1:6107189/36‑1 (MQ=255)
 cAGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGg                                   >  1:7548909‑M1/1‑35 (MQ=255)
  aGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGtt                                  >  1:5545936/1‑36 (MQ=255)
    ccGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCt                                <  1:1361068/35‑1 (MQ=255)
    aCGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGgttt                                >  1:5208002‑M1/1‑32 (MQ=255)
    aCGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCt                                <  1:5296072/36‑1 (MQ=255)
     cGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTg                               <  1:2196612/36‑1 (MQ=255)
      gTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGgttttt                              >  1:4139583‑M1/1‑30 (MQ=255)
      gTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTgg                              <  1:5505187/36‑1 (MQ=255)
        tGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGtg                            <  1:650101/36‑1 (MQ=255)
        tGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGtg                            <  1:2200919/36‑1 (MQ=255)
          ggTTATCATTGTGCTATCTCTGGCGGTTCTGGtgat                          <  1:5461172/36‑1 (MQ=255)
          ggTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGgtttgtttgt                          >  1:7744554‑M1/1‑26 (MQ=255)
          ggTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGtgat                          <  1:6375476/36‑1 (MQ=255)
          ggTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGtgat                          <  1:1034204/36‑1 (MQ=255)
             tATCATTGTGCTATCACTGGCGGgtttttttgtgtt                       >  1:7615538‑M1/1‑23 (MQ=255)
              aTCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATc                      <  1:388844/36‑1 (MQ=255)
              aTCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATc                      <  1:7890715/36‑1 (MQ=255)
              aTCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATc                      <  1:5465510/36‑1 (MQ=255)
               tCATTGTGCTATCACTGGCGGgtttttttgtgtttg                     >  1:4751279‑M1/1‑21 (MQ=255)
               tCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCg                     <  1:7325021/36‑1 (MQ=255)
                cATTGTGCTATCACTGGCGGTTCGGGTGATGATCgg                    <  1:2671447/36‑1 (MQ=255)
                 aTTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGc                   <  1:541384/36‑1 (MQ=255)
                  ttGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCa                  <  1:7536390/36‑1 (MQ=255)
                  ttGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCa                  <  1:715797/36‑1 (MQ=255)
                   tgtgCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCAt                 <  1:813708/36‑1 (MQ=255)
                    gtgCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCAtt                <  1:6451835/36‑1 (MQ=255)
                    gtgCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCAtt                <  1:7015089/36‑1 (MQ=255)
                       cTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAat             <  1:5365706/36‑1 (MQ=255)
                        tATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAata            <  1:1557575/36‑1 (MQ=255)
                         aTCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAatat           <  1:1660340/36‑1 (MQ=255)
                          tCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATg          <  1:484845/36‑1 (MQ=255)
                           cACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATgg         <  1:2669447/36‑1 (MQ=255)
                            aCTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGc        <  1:5405671/36‑1 (MQ=255)
                            aCTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGc        <  1:1544336/36‑1 (MQ=255)
                            aCTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGc        <  1:3563036/36‑1 (MQ=255)
                            aCTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGc        <  1:5221885/36‑1 (MQ=255)
                             cTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGcc       <  1:1611321/36‑1 (MQ=255)
                                 cGGTTCTGGTGATGCTCGGCATTAATATGGCCGaaa   <  1:2354162/36‑1 (MQ=255)
                                  ggTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGCCGaaaa  <  1:5252598/36‑1 (MQ=255)
                                  ggTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATAGCCGaaaa  <  1:5916219/36‑1 (MQ=255)
                                  ggTTCTGGTAATGATCGGCATTAATATGGCCGaaaa  <  1:1547142/36‑1 (MQ=255)
                                   |                                  
CCAGACGTTGGGTTATCATTGTGCTATCACTGGCGGTTCTGGTGATGATCGGCATTAATATGGCCGAAAA  >  REL606/3278081‑3278150

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 9 ≤  ATCG  < 19 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 37 ≤  ATCG